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ThreatSEQ™DNA筛查Web服务

基因合成的研究和开拓令人兴奋的新发展,并有可能暴露在世界前所未有的威胁。合成生物学的行业需要一个实用的,负责任的态度,以减少意外或故意制造关注的DNA序列的概率。

巴特尔的ThreatSEQ解决方案是提交基因合成DNA序列的快速筛选一个基于Web的分析软件工具和服务。使用特定威胁序列数据的先进算法和数以千计的,它快速,准确地检测关注的DNA序列和提供该信息以简明的报告用户。该ThreatSEQ DNA筛查服务给出了合成生物学业一个强大的新资源,以减少危险性生物将通过基因合成创建的风险,有意或无意。

该平台是由著名专家在应用基因组学,免疫学,毒理学,生物信息学,化学和生物战防御,先进的分析和网络安全,带来的是使基因序列潜在的生物安全威胁因素的深刻理解建立了十多年。

让我们携手合作,以减少生物安全威胁
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优点

该ThreatSEQ DNA筛查服务提供基因合成公司,同时保持成本的有效管理当前的半手工的和主观的DNA筛选选项,使他们能够做出更快,更好的决策来保护自己,他们的客户和社会的潜在生物安全的替代风险。

该技术实现了:

  • 较高的置信水平:大大降低错误率,并提供威胁级别的客观评估。
  • 少误报:相比于目前的筛查方法减少误报70-90个百分点。
  • 降低了人力成本:在自动提供序列特异性威胁信息结合较少的误报减少所需的调查时间的潜在威胁。
关注的序列ThreatSEQ快速DNA分析

特征

我们的技术是基于以含关心的基因序列巴特尔专有的毒力因子数据库建成威胁识别算法。由于数据库是针对已知病原体的基因组全序列特异性,而不是匹配周围的组织,该算法可以识别特定序列中的问题,并通过全面的,自动报告和威胁的状态分配通知生物安全的工作人员。

ThreatSEQ分析是基于含周围关注的基因序列巴特尔专有的毒力因子数据库建成威胁识别算法

毒力因子数据库
该数据库是建立在超过十年的研究,使病原体的危险因素。它编译关注包括850种75种细菌,96个病毒,真核12种病原体和其他贡献者病原体关注的序列的超过10,000个序列。

这些因素包括(但不限于):

  • 毒力因子
  • 抗生素耐药性
  • 免疫逃避因素
  • 人类的生物调节剂
  • 蛋白质毒素
  • 其他威胁因子(例如,阿片样物质的酶途径)
该数据库涵盖了美国选择代理和澳大利亚集团列表(1级)和几乎所有已知的细菌人/人畜共患代理的100%。为了确保最全面执行比较,用户也提供了对来自美国国家生物技术信息中心(NCBI)数据库和世界各地的其他选择代理登记衍生的生物体的基因组完整的结果。

程图ThreatSEQ是如何工作的

威胁识别算法

该算法快速扫描的威胁因素数据库中相匹配的要求DNA序列和外观。比赛可以是整个基因序列或基因序列的部分。我们的ThreatSEQ web服务已被设计为有效地操作,并检测复杂的图案(例如,瓷砖镶嵌DNA片段)。

除了识别正匹配,我们的算法提供了有关类型的基因序列可通过分析基因和它们的所得功能的结构呈现威胁的信息。现有的分析是由4400多名全文同行评议的论文支持,和巴特尔继续作为新的研究出现更新数据库和算法。

威胁报告
巴特尔的ThreatSEQ解决方案提供易于理解的报告该标志的关注和特定序列特征与序列相关的潜在危险。报告方便审核确定被请求序列构成的威胁级别和了解背后的威胁,决心的理由。

审阅者可以运行简单的跟踪和筛选结果的审核订单历史记录和威胁状况的报告。

威胁排名更有效的审查。

  • 威胁=匹配关注的已知序列
  • 潜在威胁=匹配的非注释选择剂的基因组的任何序列
  • 不大可能威胁=匹配的注释选择代理的基因组关于非序列
  • 非威胁=匹配非选择剂的基因组中的序列

应用

研究人员在实验室工作随着合成生物学产业成熟和技术变得更加强大,价格实惠,生物安全风险是越来越大。现有的解决方案提供有限的分辨率,目前越来越多的成本负担,主要是由假阳性筛选命中的人工审核驱动。

该ThreatSEQ DNA屏业务如虎添翼基因合成公司做出更快,更明智的决策来保护自己,他们的客户和社会的潜在生物安全风险。软件和分析服务提供提交生产履行基因合成请求之前确定关注的潜在的DNA序列的DNA序列的快速分析。

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