我们的技术基于基于巴特尔专利毒性因子数据库的威胁识别算法,该数据库包含了相关的基因序列。由于数据库是围绕特定序列组织的,而不是与已知病原体的全基因组进行匹配,该算法可以识别出有问题的特定序列,并通过全面、自动化的报告和分配威胁状态通知生物安全人员。

毒力因子数据库
该数据库建立在十多年来对病原体危险因素的研究基础上。它汇编了超过10,000个相关序列,包括来自75种细菌、96种病毒、12种真核病原体和其他病原体贡献者的850种相关序列。
这些因素包括(但不限于):
- 毒力因子
- 抗生素耐药性
- 免疫逃避的因素
- 人类bioregulators
- 蛋白质毒素
- 其他威胁因素(例如,阿片酶途径)
该数据库涵盖了100%的美国特定病原体和澳大利亚组名单(第一级),以及几乎所有已知的人类/人畜共患病细菌病原体。为了确保进行最全面的比较,还向用户提供了来自国家生物技术信息中心(NCBI)数据库和世界各地其他精选代理注册中心的生物全基因组的结果。
威胁识别算法
该算法快速扫描所要求的DNA序列,并在威胁因素数据库中寻找匹配。匹配可能是整个基因序列或部分基因序列。我们的ThreatSEQ web服务被设计为高效操作和检测复杂模式(例如,瓷砖马赛克DNA片段)。
除了识别阳性匹配外,我们的算法还通过分析基因的结构和功能,提供有关基因序列可能带来的威胁类型的信息。现有的分析得到了4400多篇同行评议全文论文的支持,随着新的研究出现,巴特尔继续更新数据库和算法。
威胁报告
Battelle的ThreatSEQ解决方案提供了易于理解的报告,标记了关注的特定序列,并描述了与序列相关的潜在危险。这些报告允许审查人员轻松地确定请求序列所表示的威胁级别,并理解威胁确定背后的基本原理。
审核人员可以运行订单历史记录和威胁状态报告,方便跟踪和审核筛选结果。
为了更有效的审查,对威胁进行了排名。
- 威胁匹配已知的关注序列
- 潜在的威胁匹配任何序列在一个无注释的选择代理的基因组
- 不可能的威胁匹配一个不相关的序列在一个注释的选择代理的基因组
- Non-threat匹配非选择代理的基因组序列