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AgentSeq™DNA筛选Web服务

基因合成的研究和开拓令人兴奋的新发展,并有可能暴露在世界前所未有的威胁。合成生物学的行业需要一个实用的,负责任的态度,以减少意外或故意制造关注的DNA序列的概率。

Battelle的植物威胁解决方案是一种基于Web的分析软件工具和服务,用于快速筛选用于基因合成的DNA序列。使用高级算法和数千个威胁的特定序列数据,它快速准确地检测关注的DNA序列,并在简明的报告中向用户提供此信息。The Abstseq DNA筛查服务为合成生物学行业提供了一种强大的新资源,以降低通过基因综合,意外或故意通过基因综合来创建危险生物的风险。

该平台由应用基因组学,免疫学,毒理学,生物信息学,化学和生物战争,高级分析和网络安全的领先专家建造在十年上,这会深入了解使遗传序列潜在的生物安全威胁的因素。

让我们携手合作,以减少生物安全威胁
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好处

该ThreatSEQ DNA筛查服务提供基因合成公司,同时保持成本的有效管理当前的半手工的和主观的DNA筛选选项,使他们能够做出更快,更好的决策来保护自己,他们的客户和社会的潜在生物安全的替代风险。

技术支持:

  • 较高的置信水平:大大降低了错误率,并提供了对威胁水平的客观评估。
  • 少误报:与当前筛选方法相比,将假阳性降低70-90%。
  • 降低了人力成本:与自动提供的序列特定的威胁信息相结合较少的误报,减少所需的潜在威胁的调查时间。
关注的序列ThreatSEQ快速DNA分析

特征

我们的技术基于围绕Battelle的专有毒力因子数据库附近建造的威胁识别算法,该遗传造型数据库包含遗传序列的遗传序列。由于数据库周围围绕特定序列组织而不是针对已知病原体的全基因组织,因此该算法可以通过全面,自动报告和威胁状态分配来识别有问题的特定顺序和通知生物安全人员。

威胁性分析基于围绕Battelle专有的毒力因子数据库附近构建的威胁识别算法,该遗传造型数据库包含遗传序列的遗传序列

毒力因子数据库
该数据库建立在十多年的研究中,成为使病原体危险的因素。它编制了超过10,000个关注的关注序列,该遗址包括从75种细菌,96种病毒,12种真核病原体和病原体的其他贡献者的850种令人担忧。

这些因素包括(但不限于):

  • 毒力因子
  • 抗生素耐药性
  • 免疫逃避因素
  • 人类的生物调节剂
  • 蛋白质毒素
  • 其他威胁因子(例如,阿片样物质的酶途径)
该数据库涵盖美国的100%。选择代理商和澳大利亚集团列表(第1级)和几乎所有已知的细菌人/人畜共患剂。为确保进行最全面的比较,用户还提供了针对来自国家生物技术信息(NCBI)数据库的全国各种生物的全基因组和世界各地选择代理注册表的结果。

流程图显示威胁性如何工作

威胁识别算法

该算法快速扫描的威胁因素数据库中相匹配的要求DNA序列和外观。比赛可以是整个基因序列或基因序列的部分。我们的ThreatSEQ web服务已被设计为有效地操作,并检测复杂的图案(例如,瓷砖镶嵌DNA片段)。

除了识别正匹配,我们的算法提供了有关类型的基因序列可通过分析基因和它们的所得功能的结构呈现威胁的信息。现有的分析是由4400多名全文同行评议的论文支持,和巴特尔继续作为新的研究出现更新数据库和算法。

威胁报告
Battelle的植物威胁解决方案提供了易于理解的报告,其标志为特定的关注序列并表征与序列相关的潜在危害。该报告允许审阅者轻松确定所请求的序列所提出的威胁水平,并了解威胁决定背后的理由。

审核人员可以运行订单历史记录和威胁状态报告,方便跟踪和审核筛选结果。

威胁排名更有效的审查。

  • 威胁=匹配关注的已知序列
  • 潜在的威胁=匹配的非注释选择剂的基因组的任何序列
  • 不可能的威胁=在注释选择代理的基因组中匹配非关于序列
  • 非威胁=匹配非选择代理的基因组中的序列

应用程序

研究人员在实验室工作随着合成生物行业的成熟和技术变得更加强大,实惠,生物安全风险正在增长。现有解决方案提供有限的分辨率,并提出了不断增长的成本负担,在很大程度上通过手动审查了假辐射筛选。

该ThreatSEQ DNA屏业务如虎添翼基因合成公司做出更快,更明智的决策来保护自己,他们的客户和社会的潜在生物安全风险。软件和分析服务提供提交生产履行基因合成请求之前确定关注的潜在的DNA序列的DNA序列的快速分析。

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